Grootschalige dataset en benchmark: leren eiwit-ligandmodellen bindingsplaatsen of slechts bindingswaarschijnlijkheid?

Eiwit-ligandmodellering vormt de basis van computationele medicijnontwikkeling en moleculair ontwerp. Bestaande benchmarks testen meestal óf een eiwit en ligand op elkaar inwerken en hoe sterk ze binden, via taken als binaire bindingsvoorspelling en affiniteitsregressie. Maar deze evaluaties zeggen weinig over of modellen bindingsplaatsen kunnen lokaliseren of de niet-covalente interacties kunnen herkennen die aan moleculaire herkenning ten grondslag liggen.